25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1186 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  51.46 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  36.26 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  46.84 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2050  hypothetical protein  35.58 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  27.36 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  27.1 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  36.76 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2051  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  33.7 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  35 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.205259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  21.5 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1773  protein of unknown function DUF1622  23.58 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  29.23 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  30.56 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  19.64 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2198  hypothetical protein  31.48 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.405596  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2686  protein of unknown function DUF1622  28.7 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2152  hypothetical protein  31.48 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  20 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4214  protein of unknown function DUF1622  32 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2139  hypothetical protein  31.48 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>