24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A0864 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0864  intracellular signaling protein  100 
 
 
409 aa  822    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1171  intracellular signalling protein  98.78 
 
 
690 aa  816    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  23.29 
 
 
726 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  22.06 
 
 
614 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  22.72 
 
 
564 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  22.86 
 
 
715 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  24 
 
 
716 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  24.55 
 
 
696 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  25.89 
 
 
724 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  23.19 
 
 
601 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  29.57 
 
 
940 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  22.78 
 
 
707 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21.84 
 
 
634 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 
662 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1412  diguanylate cyclase  23.27 
 
 
557 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1373  diguanylate cyclase  23.27 
 
 
557 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.949847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  22.49 
 
 
795 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  24.07 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  23.32 
 
 
631 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1389  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  23.27 
 
 
557 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2970  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  23.27 
 
 
557 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  20.87 
 
 
650 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.76 
 
 
708 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  18.7 
 
 
634 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>