25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02620 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  96.05 
 
 		 381 aa  719    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  100 
 
 		 457 aa  901    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  98.43 
 
 		 381 aa  747    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  98.69 
 
 		 305 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  98.68 
 
 		 305 aa  593  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  97.4 
 
 		 129 aa  156  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  98.68 
 
 		 150 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  94.81 
 
 		 205 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  94.81 
 
 		 128 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  89.61 
 
 		 128 aa  147  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  98.57 
 
 		 151 aa  142  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  98.57 
 
 		 154 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  95.71 
 
 		 155 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  83.78 
 
 		 360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  78.38 
 
 		 287 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  51.49 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  56 
 
 		 77 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  54.55 
 
 		 81 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  54.79 
 
 		 159 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  50.65 
 
 		 77 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02170  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  54.55 
 
 		 88 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  32.35 
 
 		 361 aa  53.5  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  30.99 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>