More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ03200 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ03200  tyrosine-tRNA ligase, putative  100 
 
 		 478 aa  983    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 419 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 419 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 420 aa  319  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119608  Tyrosyl-tRNA synthetase, probable  39.96 
 
 		 484 aa  316  7e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1507  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0498725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 431 aa  303  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 418 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 419 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0802  tyrosyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.036725  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2044  tyrosyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 415 aa  296  5e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 426 aa  296  7e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 418 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 418 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 425 aa  293  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  36.9 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 418 aa  289  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 420 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 424 aa  289  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3297  tyrosyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  39.87 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1815  tyrosyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0017  tyrosyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1536  tyrosyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 427 aa  285  9e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280779  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0148  tyrosyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 416 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000162194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1511  tyrosyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000132583 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31908  tyrosyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483177  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0081  tyrosyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 424 aa  282  9e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000172362  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0676  tyrosine--tRNA ligase  36.7 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 425 aa  279  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 424 aa  279  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1624  tyrosyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4122  tyrosyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00834024  hitchhiker  0.0000528667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1071  tyrosyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 448 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000119232  hitchhiker  0.000872394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1512  tyrosyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.675867  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0132  tyrosyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 415 aa  272  8.000000000000001e-72  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0587  hypothetical protein  36.75 
 
 		 427 aa  272  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 426 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1088  tyrosyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 434 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.200739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 423 aa  270  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>