More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00260 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM02030  conserved hypothetical protein  71.62 
 
 
527 aa  794    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00260  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1105    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00951238  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  34.55 
 
 
489 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00210  hypothetical protein  31.9 
 
 
494 aa  259  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10487  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08340)  33.06 
 
 
524 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 
489 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  33.04 
 
 
496 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02880  High-affinity nicotinic acid transporter, putative  31.76 
 
 
508 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 
533 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  30.44 
 
 
519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57264  Transporter of Nicotinic Acid  28.38 
 
 
508 aa  217  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  28.41 
 
 
523 aa  217  5e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11189  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 
495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0397486  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05810  nicotinamide mononucleotide permease, putative  29.98 
 
 
498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06883  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00110)  31.16 
 
 
465 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01850  MFS transporter, putative  29.69 
 
 
491 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10267  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15730)  29.83 
 
 
554 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213096 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  30.38 
 
 
493 aa  211  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08502  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01370)  28.12 
 
 
503 aa  210  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0656476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09010  MFS nicotinic acid transporter Tna1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03820)  29.79 
 
 
503 aa  209  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  31.48 
 
 
493 aa  209  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06590  hypothetical protein  30.36 
 
 
494 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219204  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  30.21 
 
 
455 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  28.48 
 
 
503 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06680  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 
515 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  30.08 
 
 
541 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0433622 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03221  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01000)  30.94 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61879  Transporter of Nicotinic Acid  28.21 
 
 
523 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.110717  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00030  hypothetical protein  30.11 
 
 
505 aa  194  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07648  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00840)  28.44 
 
 
513 aa  190  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000132828  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08623  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 
469 aa  189  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 
507 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09000  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14670)  29.17 
 
 
499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01990  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02831  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 
496 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983705  normal  0.0394534 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02070  nicotinamide mononucleotide permease, putative  27.63 
 
 
499 aa  184  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09392  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04010)  28.25 
 
 
568 aa  183  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08955  hypothetical protein  31.25 
 
 
473 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00570  hypothetical protein  27.46 
 
 
487 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  26.38 
 
 
512 aa  177  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00380  membrane transporter, putative  26.77 
 
 
522 aa  177  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00860  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 
501 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02800  tartrate transporter, putative  26.69 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05291  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
499 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00473  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16690)  28.34 
 
 
507 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03503  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06550)  27.25 
 
 
547 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00180  nicotinamide mononucleotide permease, putative  27.21 
 
 
540 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60854  transporter of Nicotinic Acid  27.59 
 
 
507 aa  166  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377771  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02959  transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07950)  26.39 
 
 
565 aa  163  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374716 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08814  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09470)  27.63 
 
 
529 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09336  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 
503 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00550  hypothetical protein  27.01 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  28.61 
 
 
458 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  28.36 
 
 
458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01460  allantoate transporter, putative  25.71 
 
 
548 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.44811  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05545  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 
503 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  28.36 
 
 
458 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  28.36 
 
 
458 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  28.37 
 
 
458 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  28.37 
 
 
458 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  28.37 
 
 
458 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  28.37 
 
 
458 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  28.21 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  28.78 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  28.13 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  29.87 
 
 
441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00497  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
518 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08423  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 
546 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  30.54 
 
 
448 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  31.4 
 
 
443 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  27.9 
 
 
437 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  28.93 
 
 
441 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  30.13 
 
 
442 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03066  conserved hypothetical protein  23.03 
 
 
537 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09456  MFS allantoate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03720)  26.17 
 
 
494 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100188  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00440  hypothetical protein  26.3 
 
 
526 aa  144  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04826  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09170)  27.08 
 
 
456 aa  144  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  24.35 
 
 
503 aa  143  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  30.02 
 
 
448 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  30.02 
 
 
448 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  26.97 
 
 
441 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.95 
 
 
442 aa  143  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  29.17 
 
 
428 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10720  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15390)  25.05 
 
 
503 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0939876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  29.17 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06461  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 
533 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  26.59 
 
 
462 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  26.96 
 
 
441 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  26.96 
 
 
441 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02663  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  27.07 
 
 
441 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05032  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
449 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  29.85 
 
 
456 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  29.85 
 
 
456 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  29.85 
 
 
450 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07050  hypothetical protein  23.73 
 
 
518 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.94962  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07280  transporter, putative  22.91 
 
 
524 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  30.05 
 
 
449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10428  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 
491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>