26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06130 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND06130  conserved hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1246    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.533369  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06160  conserved hypothetical protein  72.71 
 
 
588 aa  851    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00380  glucosidase, putative  57.56 
 
 
623 aa  580  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00410  beta-glucan synthesis-associated protein, putative  54.21 
 
 
622 aa  566  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00550  glucosidase, putative  57.43 
 
 
619 aa  566  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01640  glucosidase, putative  48.34 
 
 
834 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75745  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  42.67 
 
 
695 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10779  putative 1,6-beta-glucan synthetase (Eurofung)  43.87 
 
 
632 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65263  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  42.32 
 
 
653 aa  382  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63619  Beta-glucan synthesis-associated protein  42.4 
 
 
482 aa  344  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50238  predicted protein  28.03 
 
 
625 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48300  predicted protein  35.59 
 
 
746 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0439212  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56509  predicted protein  25.11 
 
 
669 aa  118  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  29.46 
 
 
383 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 
389 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  28.23 
 
 
409 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  34.62 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  31.46 
 
 
467 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.15 
 
 
1290 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  31.36 
 
 
274 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  29.92 
 
 
301 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 
556 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.7 
 
 
1059 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  30.13 
 
 
330 aa  44.3  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.58 
 
 
503 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.57 
 
 
819 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>