25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04760 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1221 aa  2496    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  41.68 
 
 		 1175 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77995  predicted protein  36.39 
 
 		 1127 aa  209  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66941  predicted protein  26.79 
 
 		 794 aa  107  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10071  RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02510)  23.72 
 
 		 650 aa  99.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.873543 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04280  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 		 948 aa  96.3  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.429962  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2772  predicted protein  25.4 
 
 		 326 aa  80.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0544491  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9143  predicted protein  24.14 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80937  protein necessary for high temperature growth  23.08 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86424  Translational repressor Pumilio/PUF3 and related RNA-binding proteins (Puf superfamily)  22.07 
 
 		 835 aa  73.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06587  mRNA binding protein Pumilio 2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04310)  19.58 
 
 		 849 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209854  normal  0.827915 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07480  differentiation regulator (Nrd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05670)  40 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.635834 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04890  cytoplasm protein, putative  22.75 
 
 		 706 aa  60.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04870  hypothetical protein  20.87 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  22.54 
 
 		 499 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  35.71 
 
 		 184 aa  52.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67503  predicted protein  31.86 
 
 		 619 aa  52  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.50882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  22.69 
 
 		 632 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  23.86 
 
 		 690 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67901  predicted protein  23.62 
 
 		 1257 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29004  normal  0.614914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  32.05 
 
 		 103 aa  49.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  34.62 
 
 		 223 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  33.71 
 
 		 441 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  25 
 
 		 605 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  26.92 
 
 		 112 aa  45.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>