16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86424 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86424  Translational repressor Pumilio/PUF3 and related RNA-binding proteins (Puf superfamily)  100 
 
 		 835 aa  1712    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06587  mRNA binding protein Pumilio 2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04310)  43.1 
 
 		 849 aa  303  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209854  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04870  hypothetical protein  41.1 
 
 		 673 aa  267  5.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11337  predicted protein  40.62 
 
 		 319 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10071  RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02510)  33.33 
 
 		 650 aa  221  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.873543 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04280  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 		 948 aa  202  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.429962  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66941  predicted protein  29.82 
 
 		 794 aa  176  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2772  predicted protein  31.21 
 
 		 326 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0544491  normal  0.134886 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04285  Pumilio-family RNA binding repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G04340)  29.33 
 
 		 802 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80937  protein necessary for high temperature growth  29.05 
 
 		 528 aa  134  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9143  predicted protein  29.29 
 
 		 304 aa  117  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  21.85 
 
 		 1221 aa  75.9  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  21.16 
 
 		 1175 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77995  predicted protein  24.32 
 
 		 1127 aa  65.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44147  predicted protein  24.62 
 
 		 714 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10173  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 		 709 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>