14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66941 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_66941  predicted protein  100 
 
 		 794 aa  1630    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10071  RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02510)  47.09 
 
 		 650 aa  338  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.873543 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04280  conserved hypothetical protein  43.53 
 
 		 948 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.429962  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2772  predicted protein  45.86 
 
 		 326 aa  287  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0544491  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9143  predicted protein  36.56 
 
 		 304 aa  211  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04870  hypothetical protein  31.96 
 
 		 673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80937  protein necessary for high temperature growth  33.8 
 
 		 528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86424  Translational repressor Pumilio/PUF3 and related RNA-binding proteins (Puf superfamily)  30.24 
 
 		 835 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06587  mRNA binding protein Pumilio 2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04310)  27.41 
 
 		 849 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209854  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11337  predicted protein  31.07 
 
 		 319 aa  147  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 1221 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  33.93 
 
 		 1175 aa  99  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04285  Pumilio-family RNA binding repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G04340)  25.84 
 
 		 802 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77995  predicted protein  25.64 
 
 		 1127 aa  76.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>