14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9143 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9143  predicted protein  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2772  predicted protein  40.69 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0544491  normal  0.134886 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10071  RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02510)  37.09 
 
 		 650 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.873543 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04280  conserved hypothetical protein  38.94 
 
 		 948 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.429962  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66941  predicted protein  36.56 
 
 		 794 aa  211  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80937  protein necessary for high temperature growth  28.97 
 
 		 528 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06587  mRNA binding protein Pumilio 2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04310)  29.13 
 
 		 849 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209854  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86424  Translational repressor Pumilio/PUF3 and related RNA-binding proteins (Puf superfamily)  29.29 
 
 		 835 aa  118  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04870  hypothetical protein  26.95 
 
 		 673 aa  116  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11337  predicted protein  29 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 		 1221 aa  79.3  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77995  predicted protein  27.84 
 
 		 1127 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04285  Pumilio-family RNA binding repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G04340)  22.22 
 
 		 802 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  24.86 
 
 		 1175 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>