15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04280 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC04280  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 948 aa  1954    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.429962  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10071  RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02510)  56.76 
 
 		 650 aa  415  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.873543 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2772  predicted protein  49.69 
 
 		 326 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0544491  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66941  predicted protein  43.53 
 
 		 794 aa  303  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04870  hypothetical protein  33.53 
 
 		 673 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80937  protein necessary for high temperature growth  40.32 
 
 		 528 aa  218  5.9999999999999996e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9143  predicted protein  38.94 
 
 		 304 aa  214  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86424  Translational repressor Pumilio/PUF3 and related RNA-binding proteins (Puf superfamily)  32.54 
 
 		 835 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11337  predicted protein  33.33 
 
 		 319 aa  185  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06587  mRNA binding protein Pumilio 2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04310)  29.15 
 
 		 849 aa  177  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209854  normal  0.827915 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  25.34 
 
 		 1175 aa  97.8  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04285  Pumilio-family RNA binding repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G04340)  25.34 
 
 		 802 aa  95.9  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_006686  CND04760  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 		 1221 aa  95.5  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77995  predicted protein  24.89 
 
 		 1127 aa  61.6  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80365  Puf family RNA-binding protein Translation, ribosomal structure and biogenesis  22.47 
 
 		 679 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0157641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>