30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04750 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  357  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  59.76 
 
 		 173 aa  217  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  50 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01521  RNA polymerase II subunit 7 (AFU_orthologue; AFUA_8G05300)  45.29 
 
 		 169 aa  167  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  38.86 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.19 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.52 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.52 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  26.32 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.86 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.19 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.7 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.48 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  22.41 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.19 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  22.45 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  21.94 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.16 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  21.48 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.43 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.57 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.07 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  20.41 
 
 		 199 aa  50.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.97 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.53 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  29.53 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  26.53 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.85 
 
 		 192 aa  47.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.49 
 
 		 189 aa  42  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  29.81 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>