More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0955 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  74.29 
 
 		 227 aa  334  7.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  68.14 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  70 
 
 		 214 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  63.85 
 
 		 223 aa  298  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  65.09 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  61.03 
 
 		 225 aa  284  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  59.26 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  55.9 
 
 		 217 aa  211  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  55.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  54.9 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  54.9 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  54.9 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  54.9 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  54.9 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  55.78 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  50.24 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  54.77 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  55.28 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  55.28 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  55.28 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  51.28 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  51.28 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  50.77 
 
 		 216 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  51.28 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  55.11 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  50.25 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  55.11 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  54.77 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  54.77 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  53.63 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  50.98 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  45.92 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  45.74 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  45.11 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  45.16 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  45.7 
 
 		 187 aa  158  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  44.04 
 
 		 200 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  43.24 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  48.86 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  44.97 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  41.4 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  41.53 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  43.65 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  41.4 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  44.02 
 
 		 199 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  44.5 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  40.8 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  41.09 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  41.4 
 
 		 189 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  44.81 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 190 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  43.26 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  44.12 
 
 		 182 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  44.02 
 
 		 207 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  37.5 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  41.09 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  39.23 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  41.29 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  41.29 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  43.39 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  40.59 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  39.69 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  43.39 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  43.48 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  42.61 
 
 		 192 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  41.29 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  43.72 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  41.48 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  41.85 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  44.57 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  39.18 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>