More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1668 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1668  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
176 aa  362  1e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0130356  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1321  transcription antitermination protein NusG  78.98 
 
 
176 aa  297  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  76.14 
 
 
176 aa  291  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0169  transcription antitermination protein NusG  76.14 
 
 
176 aa  289  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0213318  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0348  transcription termination/antitermination factor NusG  73.86 
 
 
176 aa  275  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0068179  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0523  transcription antitermination protein NusG  75.72 
 
 
177 aa  274  4e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0829173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0503  transcription antitermination protein NusG  75.72 
 
 
177 aa  274  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000847234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0444  transcription antitermination protein NusG  74.43 
 
 
176 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00370515  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1461  transcription antitermination protein NusG  75.72 
 
 
177 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0348  transcription antitermination protein NusG  57.8 
 
 
179 aa  216  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000375919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  44.89 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  43.75 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  42.05 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  42.05 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  44.32 
 
 
177 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  42.77 
 
 
195 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  44.32 
 
 
177 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 
177 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 
177 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  43.43 
 
 
177 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 
177 aa  168  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 
177 aa  168  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 
176 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  43.18 
 
 
177 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  42.29 
 
 
199 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 
177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 
177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 
177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  44.07 
 
 
177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  40.91 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  42.61 
 
 
177 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  41.81 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  42.61 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  45.14 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  43.18 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  43.75 
 
 
177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  45.09 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  44.07 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  39.77 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  43.18 
 
 
177 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  39.66 
 
 
185 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  39.66 
 
 
185 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  42.61 
 
 
176 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  41.95 
 
 
190 aa  160  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  42.86 
 
 
175 aa  160  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  46.24 
 
 
180 aa  160  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  43.75 
 
 
176 aa  160  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  42.86 
 
 
175 aa  160  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  43.68 
 
 
197 aa  160  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  43.1 
 
 
196 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  43.1 
 
 
196 aa  160  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  41.38 
 
 
182 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 
194 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 
194 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  41.71 
 
 
199 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  42.7 
 
 
179 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  39.08 
 
 
185 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  42.29 
 
 
175 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 
177 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  38.51 
 
 
185 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  38.51 
 
 
185 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  38.51 
 
 
185 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  41.04 
 
 
181 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  42.05 
 
 
177 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  38.51 
 
 
185 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  44.89 
 
 
180 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  38.51 
 
 
185 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  40.57 
 
 
190 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  41.14 
 
 
198 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.56368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>