56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1351 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  56.15 
 
 
251 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  54.08 
 
 
234 aa  255  4e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  54.04 
 
 
239 aa  255  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  44.86 
 
 
248 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  45.19 
 
 
246 aa  226  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  41 
 
 
249 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  41 
 
 
249 aa  204  9e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  40.34 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  34.16 
 
 
253 aa  175  8e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  24.04 
 
 
272 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.03 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 
355 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 
286 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 
358 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 
358 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 
358 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
359 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  36.26 
 
 
285 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.11 
 
 
283 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 
338 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 
367 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  36.49 
 
 
448 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  25.29 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.63 
 
 
357 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  25.13 
 
 
311 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  48.84 
 
 
276 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
369 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  23.39 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 
283 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>