More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1484 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1484  inner membrane protein YicO  100 
 
 
430 aa  841    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0221  inner membrane protein YicO  82.03 
 
 
443 aa  698    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1685  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.7 
 
 
429 aa  597  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0583  xanthine/uracil permease family protein  66.67 
 
 
443 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.628445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0399  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.38 
 
 
428 aa  551  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0428  xanthine/uracil permease family protein  59.95 
 
 
440 aa  525  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1372  xanthine/uracil permease family protein  59.86 
 
 
439 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0281  xanthine/uracil permease family protein  58.49 
 
 
439 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1561  xanthine/uracil permease family protein  58.49 
 
 
439 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.5 
 
 
431 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 
431 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.04 
 
 
429 aa  342  8e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.55 
 
 
431 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.79 
 
 
441 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  44.99 
 
 
428 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  43.91 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.36 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.42 
 
 
431 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.69 
 
 
434 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.65 
 
 
431 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.69 
 
 
434 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.81 
 
 
433 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.72 
 
 
429 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  42.42 
 
 
431 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.2 
 
 
429 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.96 
 
 
429 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.96 
 
 
429 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  43.13 
 
 
431 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
429 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  42.89 
 
 
431 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  42.18 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.86 
 
 
433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.19 
 
 
430 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 
440 aa  327  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.02 
 
 
430 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  41.57 
 
 
429 aa  325  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  43.45 
 
 
430 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  42.89 
 
 
430 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 
433 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.89 
 
 
431 aa  322  7e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.05 
 
 
429 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  42.28 
 
 
429 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  43.33 
 
 
430 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.81 
 
 
429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.05 
 
 
429 aa  319  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  42.29 
 
 
430 aa  319  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.38 
 
 
454 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 
460 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.49 
 
 
436 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.23 
 
 
430 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  41.82 
 
 
429 aa  316  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.67 
 
 
446 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.9 
 
 
433 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.32 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.95 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.86 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.38 
 
 
453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.98 
 
 
432 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  39.43 
 
 
433 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.03 
 
 
431 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.33 
 
 
429 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.59 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  41.49 
 
 
429 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.81 
 
 
431 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  41.36 
 
 
453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  40.76 
 
 
453 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  40.14 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  40.14 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  41.14 
 
 
482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  40.14 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  40.14 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  39.43 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  39.43 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  39.43 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  39.43 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.57 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  39.19 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.23 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  39.32 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  40.79 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.19 
 
 
432 aa  304  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B22  putative guanine/xanthine permease  42.18 
 
 
451 aa  301  1e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.07 
 
 
433 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  38.35 
 
 
433 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.22 
 
 
442 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  42.07 
 
 
434 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.36 
 
 
441 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  39.41 
 
 
465 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  39.18 
 
 
465 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.31 
 
 
433 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.72 
 
 
438 aa  299  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.57 
 
 
448 aa  299  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.57 
 
 
470 aa  298  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>