More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0424 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0424  fumarate reductase iron-sulfur subunit  100 
 
 
239 aa  494  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2206  fumarate reductase iron-sulfur subunit  95.82 
 
 
239 aa  478  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0414  fumarate reductase iron-sulfur subunit  87.03 
 
 
246 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00379964  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0858  fumarate reductase iron-sulfur subunit  79.75 
 
 
243 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0396  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  77.41 
 
 
240 aa  407  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000158386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0335  fumarate reductase iron-sulfur subunit  74.68 
 
 
241 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0459  fumarate reductase iron-sulfur subunit  73 
 
 
241 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1547  fumarate reductase iron-sulfur subunit  73 
 
 
241 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0434  fumarate reductase iron-sulfur subunit  73 
 
 
241 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1776  fumarate reductase iron-sulfur subunit  62.82 
 
 
252 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2460  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.32 
 
 
247 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1067  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.75 
 
 
259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.446689  normal  0.284622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1532  fumarate reductase iron-sulfur subunit  61.44 
 
 
261 aa  304  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1494  fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.12 
 
 
245 aa  304  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3064  fumarate reductase iron-sulfur subunit  58.51 
 
 
245 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0678  fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.72 
 
 
241 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0641  fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.3 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1256  fumarate reductase iron-sulfur subunit  58.47 
 
 
262 aa  300  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0636  fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.3 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0614  fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.3 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3751  fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.3 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0458  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.04 
 
 
241 aa  295  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0335  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.51 
 
 
243 aa  294  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0395  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.93 
 
 
247 aa  292  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0399  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.51 
 
 
243 aa  292  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0405  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.51 
 
 
243 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3620  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.51 
 
 
243 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0404  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.51 
 
 
243 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00894043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0510  fumarate reductase iron-sulfur subunit  54.66 
 
 
243 aa  291  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000519378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4075  fumarate reductase iron-sulfur subunit  54.66 
 
 
243 aa  290  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4113  fumarate reductase iron-sulfur subunit  54.43 
 
 
243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3219  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.59 
 
 
242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3959  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.81 
 
 
243 aa  287  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3934  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.39 
 
 
243 aa  287  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3882  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.39 
 
 
243 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000885392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0126  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.51 
 
 
247 aa  286  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3438  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.39 
 
 
243 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1998  fumarate reductase iron-sulfur subunit  54.66 
 
 
255 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0641746  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1931  fumarate reductase iron-sulfur subunit  49.37 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2078  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.47 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1278  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.74 
 
 
256 aa  135  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00864476  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1989  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.9 
 
 
296 aa  135  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496278  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2343  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  35.17 
 
 
344 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0381  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.82 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0935  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.2 
 
 
293 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2789  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
247 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0470  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.82 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3127  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.78 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0596  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.05 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0577  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.05 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0715  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.65 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1994  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  33.9 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3814  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.65 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2231  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.53 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3668  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.65 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3937  fumarate reductase iron-sulfur subunit  29.73 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0418  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.73 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4620  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.45 
 
 
244 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4760  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.45 
 
 
244 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.596932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4739  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.45 
 
 
244 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4703  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.45 
 
 
244 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4612  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.45 
 
 
244 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.628867  normal  0.949615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002236  succinate dehydrogenase iron-sulfur protein  32.43 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00132  fumarate reductase iron-sulfur subunit  32.43 
 
 
252 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3837  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.67 
 
 
244 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3759  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3857  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04025  fumarate reductase (anaerobic), Fe-S subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4685  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5671  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.123167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4712  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1724  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.03 
 
 
258 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4624  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03987  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4397  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2833  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.91 
 
 
309 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0372302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0342  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.91 
 
 
244 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000194904 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0762  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.91 
 
 
241 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0176  succinate dehydrogenase subunit B  31.69 
 
 
356 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11585  fumarate reductase iron-sulfur subunit frdB  29.95 
 
 
246 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0631351  normal  0.974631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1929  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.91 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1836  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.48 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0319754  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2103  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.31 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2629  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.91 
 
 
235 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2270  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.91 
 
 
235 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0879984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2509  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.91 
 
 
235 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0253294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2516  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.91 
 
 
235 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3279  fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.07 
 
 
245 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1835  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.91 
 
 
235 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0785483  normal  0.205707 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0128  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  32.63 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.579752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0353  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.88 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0249  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.1 
 
 
340 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.237523  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0171  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.14 
 
 
316 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0886  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  28.21 
 
 
253 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1266  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.47 
 
 
238 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2716  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.78 
 
 
344 aa  118  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0261  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  27.73 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7242  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.94 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1426  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.48 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0151573  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0670  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.29 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.764736  normal  0.83201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>