More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1776 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1776  fumarate reductase iron-sulfur subunit  100 
 
 
252 aa  516  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1494  fumarate reductase iron-sulfur subunit  70.59 
 
 
245 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0424  fumarate reductase iron-sulfur subunit  62.82 
 
 
239 aa  330  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1067  fumarate reductase iron-sulfur subunit  63.03 
 
 
259 aa  329  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.446689  normal  0.284622 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2206  fumarate reductase iron-sulfur subunit  62.13 
 
 
239 aa  326  3e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0858  fumarate reductase iron-sulfur subunit  61.54 
 
 
243 aa  324  9e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2460  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.5 
 
 
247 aa  321  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0414  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.4 
 
 
246 aa  319  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00379964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3064  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.66 
 
 
245 aa  319  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1532  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.08 
 
 
261 aa  318  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1256  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.24 
 
 
262 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0396  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  58.97 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000158386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0335  fumarate reductase iron-sulfur subunit  62.03 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0458  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.34 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0126  fumarate reductase iron-sulfur subunit  56.72 
 
 
247 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0395  fumarate reductase iron-sulfur subunit  61.02 
 
 
247 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1998  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.46 
 
 
255 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0641746  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0678  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.43 
 
 
241 aa  298  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0510  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.67 
 
 
243 aa  298  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000519378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3751  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.59 
 
 
241 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0636  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.59 
 
 
241 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0641  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.59 
 
 
241 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0614  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.59 
 
 
241 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4113  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.76 
 
 
243 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3882  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.66 
 
 
243 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000885392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0404  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.41 
 
 
243 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00894043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0399  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.41 
 
 
243 aa  295  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0405  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.41 
 
 
243 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3620  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.41 
 
 
243 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3438  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.24 
 
 
243 aa  295  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3934  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.24 
 
 
243 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4075  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59 
 
 
243 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3219  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.43 
 
 
242 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3959  fumarate reductase iron-sulfur subunit  58.58 
 
 
243 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0335  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.51 
 
 
241 aa  291  5e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0459  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.08 
 
 
241 aa  288  6e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1547  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.08 
 
 
241 aa  288  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0434  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.08 
 
 
241 aa  288  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1931  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.59 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0596  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.85 
 
 
240 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0577  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.85 
 
 
240 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1278  fumarate reductase iron-sulfur subunit  32.16 
 
 
256 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00864476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1266  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.16 
 
 
238 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1836  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.76 
 
 
235 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0319754  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3279  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.7 
 
 
245 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2078  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  30.61 
 
 
295 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0935  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.41 
 
 
293 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2516  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.33 
 
 
235 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2509  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.33 
 
 
235 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0253294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2629  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.33 
 
 
235 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2231  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.64 
 
 
252 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1835  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.33 
 
 
235 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0785483  normal  0.205707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3215  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  30.74 
 
 
253 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3127  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.29 
 
 
292 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1699  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.89 
 
 
231 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1989  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  30.67 
 
 
296 aa  122  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496278  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0470  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.05 
 
 
244 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0381  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.51 
 
 
244 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0891  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0768  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0794  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0829  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1724  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32 
 
 
258 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0858  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0007022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0737  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
238 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.959828  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0751  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
238 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0816  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
238 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.715359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0772  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
238 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0643  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
238 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2931  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
238 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1861  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  28.92 
 
 
262 aa  121  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2605  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  29.87 
 
 
253 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.813955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2911  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  35.42 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.327846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  35.78 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002236  succinate dehydrogenase iron-sulfur protein  33.18 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2270  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.48 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0879984  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0762  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.46 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1929  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  31.9 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2789  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.48 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2815  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.19 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0353  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1634  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.48 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.241417  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1709  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.48 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0856361  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2801  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.45 
 
 
234 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.261563  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0784  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.3 
 
 
232 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00132  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.18 
 
 
252 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0732  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  27.16 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.296183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00684  succinate dehydrogenase, FeS subunit  35 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0125  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.07 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00673  hypothetical protein  35 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2103  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  30.74 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3668  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.05 
 
 
244 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0715  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.05 
 
 
244 aa  118  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3814  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.05 
 
 
244 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1225  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.05 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1709  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.33 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2344  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.05 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0657231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2969  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.88 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1654  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.62 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.224202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4620  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.05 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>