More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1532 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1532  fumarate reductase iron-sulfur subunit  100 
 
 
261 aa  544  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1256  fumarate reductase iron-sulfur subunit  74.7 
 
 
262 aa  410  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3064  fumarate reductase iron-sulfur subunit  67.49 
 
 
245 aa  357  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1067  fumarate reductase iron-sulfur subunit  65.22 
 
 
259 aa  352  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.446689  normal  0.284622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2460  fumarate reductase iron-sulfur subunit  66.39 
 
 
247 aa  350  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1998  fumarate reductase iron-sulfur subunit  64.78 
 
 
255 aa  349  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0641746  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0126  fumarate reductase iron-sulfur subunit  64.23 
 
 
247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1776  fumarate reductase iron-sulfur subunit  60.08 
 
 
252 aa  318  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0414  fumarate reductase iron-sulfur subunit  62.29 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00379964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1494  fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.79 
 
 
245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0424  fumarate reductase iron-sulfur subunit  61.44 
 
 
239 aa  304  9.000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2206  fumarate reductase iron-sulfur subunit  59.92 
 
 
239 aa  301  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0858  fumarate reductase iron-sulfur subunit  58.9 
 
 
243 aa  299  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1931  fumarate reductase iron-sulfur subunit  57.87 
 
 
247 aa  296  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0335  fumarate reductase iron-sulfur subunit  58.3 
 
 
241 aa  288  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0434  fumarate reductase iron-sulfur subunit  57.45 
 
 
241 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0459  fumarate reductase iron-sulfur subunit  57.45 
 
 
241 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1547  fumarate reductase iron-sulfur subunit  57.45 
 
 
241 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0396  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  57.94 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000158386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0399  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.08 
 
 
243 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0405  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.08 
 
 
243 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3620  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.08 
 
 
243 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0458  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.97 
 
 
241 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0404  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.08 
 
 
243 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00894043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4075  fumarate reductase iron-sulfur subunit  51.67 
 
 
243 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4113  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.54 
 
 
243 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0335  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.5 
 
 
243 aa  261  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0510  fumarate reductase iron-sulfur subunit  51.25 
 
 
243 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000519378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3959  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.83 
 
 
243 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3934  fumarate reductase iron-sulfur subunit  51.05 
 
 
243 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3882  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.42 
 
 
243 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000885392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0678  fumarate reductase iron-sulfur subunit  51.04 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3438  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.63 
 
 
243 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0636  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.62 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0641  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.62 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3751  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.62 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0614  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.62 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0395  fumarate reductase iron-sulfur subunit  51.45 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3219  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50 
 
 
242 aa  248  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1989  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.47 
 
 
296 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496278  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2078  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.33 
 
 
295 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2789  fumarate reductase iron-sulfur subunit  34.7 
 
 
247 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0935  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.34 
 
 
293 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2231  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.77 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2833  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  29.05 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0372302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1383  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.34 
 
 
238 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543386  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2969  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.34 
 
 
238 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002236  succinate dehydrogenase iron-sulfur protein  31.58 
 
 
252 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2882  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.34 
 
 
238 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2915  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  36.93 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1143  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  36.93 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1481  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  35.42 
 
 
233 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1266  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.13 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2513  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.5 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.60219 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1278  fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.84 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00864476  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3127  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  28.03 
 
 
292 aa  128  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0101  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.52 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0110  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.52 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.767469  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00132  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.17 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0794  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.19 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0829  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.19 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0891  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.19 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0264  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.63 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0858  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.19 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0007022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0768  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.19 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0596  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.12 
 
 
240 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0577  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.12 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0362  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein  32.08 
 
 
235 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0353  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
246 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00684  succinate dehydrogenase, FeS subunit  37.29 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00673  hypothetical protein  37.29 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2911  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  37.29 
 
 
238 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.327846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2931  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
238 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0751  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
238 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2218  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.86 
 
 
235 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0816  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
238 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.715359  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01874  succinate dehydrogenase catalytic subunit  36.25 
 
 
236 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000253868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1216  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.76 
 
 
236 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0772  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
238 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0643  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
238 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0737  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
238 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.959828  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2629  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
235 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1835  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
235 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0785483  normal  0.205707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2516  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
235 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2509  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
235 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0253294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2483  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
233 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.571156  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3279  fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.69 
 
 
245 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2815  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.83 
 
 
235 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5773  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.63 
 
 
235 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482107  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1836  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
235 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0319754  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3101  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.27 
 
 
238 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1929  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
235 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2322  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
233 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1235  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
238 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0470  fumarate reductase iron-sulfur subunit  31.96 
 
 
244 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0381  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.79 
 
 
244 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1225  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.85 
 
 
238 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2184  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
235 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1709  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
235 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0856361  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0404  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  30.97 
 
 
329 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>