More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0358 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  100 
 
 
286 aa  565  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  80.35 
 
 
286 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  58.97 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  61.01 
 
 
281 aa  323  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  58.04 
 
 
284 aa  317  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  55.48 
 
 
283 aa  295  6e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  53.96 
 
 
278 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  53.6 
 
 
278 aa  278  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  52.88 
 
 
278 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  49.06 
 
 
280 aa  225  8e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  49.14 
 
 
286 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  45.76 
 
 
295 aa  195  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  36.93 
 
 
286 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.48 
 
 
289 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.36 
 
 
283 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  36.52 
 
 
286 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.36 
 
 
283 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.29 
 
 
283 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  35.05 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.6 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  45.89 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  45.89 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.29 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  36.49 
 
 
284 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.36 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  44.75 
 
 
287 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  41.95 
 
 
281 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  42.08 
 
 
401 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  40.83 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  38.57 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  43.32 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  35.52 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.93 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.48 
 
 
282 aa  178  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  40 
 
 
283 aa  178  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  37.68 
 
 
278 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  44.07 
 
 
306 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  38.11 
 
 
303 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  40.09 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  35.84 
 
 
286 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.09 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  34.93 
 
 
291 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  38.06 
 
 
272 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  37.8 
 
 
286 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  41.74 
 
 
306 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  35.31 
 
 
303 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.51 
 
 
272 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  42.5 
 
 
282 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40 
 
 
283 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  42.68 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  39 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  34.24 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.68 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  34.92 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  36.18 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  34.24 
 
 
303 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.82 
 
 
285 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  40.91 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.4 
 
 
274 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  44.15 
 
 
256 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.03 
 
 
294 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  38.18 
 
 
293 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.21 
 
 
304 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  41.63 
 
 
283 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  35.03 
 
 
290 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  43.84 
 
 
268 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  36.86 
 
 
294 aa  169  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  45.09 
 
 
297 aa  169  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  34.23 
 
 
321 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  37.45 
 
 
280 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  44.15 
 
 
256 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  37.11 
 
 
289 aa  168  8e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  35.99 
 
 
284 aa  168  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  36.64 
 
 
282 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  41.28 
 
 
310 aa  168  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  35.76 
 
 
289 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  35.74 
 
 
292 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  32.99 
 
 
290 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  32.99 
 
 
288 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.93 
 
 
302 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  39.22 
 
 
322 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.28 
 
 
284 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  33.91 
 
 
292 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  38.2 
 
 
300 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  39.38 
 
 
296 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  43.04 
 
 
312 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  33.65 
 
 
319 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  38.98 
 
 
422 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  37.77 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  33.11 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  36.19 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  37.77 
 
 
296 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  33.22 
 
 
301 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  41.89 
 
 
293 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  36.16 
 
 
295 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  33.55 
 
 
313 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  35.31 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  34.31 
 
 
311 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  33.45 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  33.45 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>