23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0343 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0343  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0274665  hitchhiker  0.000359289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  59.62 
 
 
559 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  60.42 
 
 
578 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  60.42 
 
 
578 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  60.42 
 
 
578 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  58.14 
 
 
578 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  60 
 
 
248 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  60 
 
 
578 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  60 
 
 
580 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  54.35 
 
 
575 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  47.73 
 
 
580 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  43.48 
 
 
566 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  47.73 
 
 
588 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  50 
 
 
563 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  54.05 
 
 
566 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  47.5 
 
 
566 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  47.5 
 
 
565 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  47.5 
 
 
565 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  47.5 
 
 
565 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  58.62 
 
 
565 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  47.5 
 
 
565 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  58.62 
 
 
565 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  54.29 
 
 
559 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>