27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2459 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  66.07 
 
 
357 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  46.91 
 
 
330 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  49.39 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  43.96 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  42.14 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  36.22 
 
 
318 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  32.33 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  34.18 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  32.88 
 
 
299 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  31.55 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  26.51 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  28.81 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  21.64 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  23.6 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  22.36 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  20.75 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  20.81 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  24.74 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  27.43 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  24.22 
 
 
319 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  25.29 
 
 
295 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  25.42 
 
 
299 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.28 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  25.48 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  30.56 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  22.51 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>