25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2712 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  73.63 
 
 		 411 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  37.06 
 
 		 421 aa  252  8.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  33.33 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 480 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 556 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  25.78 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  23.9 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3820  General substrate transporter  33.65 
 
 		 600 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>