27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0609 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0609  spore coat U  100 
 
 
324 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000112798  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0613  hypothetical protein  40.91 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000013147  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  27.97 
 
 
163 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  29.37 
 
 
160 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  30.91 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  30.7 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  26.58 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  31.54 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  37.11 
 
 
179 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  29.63 
 
 
153 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  36.36 
 
 
333 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  33.59 
 
 
170 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  40.28 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  40.28 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  30.22 
 
 
154 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  29.37 
 
 
160 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  30.22 
 
 
154 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  36.76 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  31.31 
 
 
184 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  31.31 
 
 
184 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  27.1 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  27.1 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  27.1 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  27.1 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  27.1 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  27.1 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  34.23 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>