More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6304 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  90.03 
 
 		 296 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  85.51 
 
 		 297 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  81.59 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  81.59 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  79.51 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  81.59 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  81.59 
 
 		 301 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  77.74 
 
 		 304 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  78.12 
 
 		 304 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  77.58 
 
 		 291 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  78.72 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  79.08 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  78.72 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  78.72 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  78.72 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  79.08 
 
 		 293 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  78.72 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  77.3 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  56.43 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  54.61 
 
 		 285 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  56.32 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  57.61 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  54.23 
 
 		 287 aa  301  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  54.64 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  55.36 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  54.29 
 
 		 295 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  57.09 
 
 		 277 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  56 
 
 		 277 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  55.27 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  54.91 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  55.43 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  54.91 
 
 		 279 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  54.91 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  54.35 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  53.79 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  56.47 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  54.64 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  54.71 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  52.73 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  54.77 
 
 		 276 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  54.91 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  54.91 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  54.91 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  54.71 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  51.97 
 
 		 291 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 		 650 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  48.89 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 		 332 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  43.17 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  49.27 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 		 329 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  46.69 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  48.18 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1269  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0263793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  43.82 
 
 		 333 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.743742  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0236  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5401  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3235  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 332 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 		 553 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 340 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3972  ABC transporter related  45.02 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1858  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.26 
 
 		 545 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1988  oligopeptide transporter ATP-binding component  46.18 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.95 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  48.84 
 
 		 566 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  43.68 
 
 		 536 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2995  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 		 333 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  44.27 
 
 		 550 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  43.36 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  43.68 
 
 		 536 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7171  peptide ABC transporter ATP-binding protein  45.32 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3839  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3947  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>