100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2223 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
126 aa  261  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0432529  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2048  methylmalonyl-CoA epimerase  96.83 
 
 
126 aa  255  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4104  hypothetical protein  48.03 
 
 
143 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6219  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.46 
 
 
143 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000185613  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7657  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.644401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.62 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1481  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282655  normal  0.113299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1264  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0246798 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6021  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.346989  normal  0.446573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.616957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5312  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  29.93 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2999  glyoxalase family protein  28.95 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441572  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2694  hypothetical protein  28.95 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5509  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  29.2 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53700  ring-cleaving dioxygenase  36.46 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392285  hitchhiker  0.0045511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4701  ring-cleaving dioxygenase  37.5 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.653118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.07 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  29.52 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000851602  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  27.91 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  26.24 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  27.27 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  27.74 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  26.85 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  28.32 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  28.32 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  28.32 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  28.32 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  28.32 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  28.32 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  28.32 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  28.32 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  27.43 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  27.43 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  27.43 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  27.43 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  27.43 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  47.37 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  28.36 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  27.73 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  27.62 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.33 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  27.61 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  27.62 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  27.62 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.29 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  27.74 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  27.43 
 
 
131 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2283  lactoylglutathione lyase  24.81 
 
 
146 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  30.7 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  29.6 
 
 
201 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  30.7 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  24.62 
 
 
128 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  30.39 
 
 
137 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6130  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1552  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 
132 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3401  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.55 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356805  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  27.01 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  24.07 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  25.93 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  24.77 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  26.13 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  26.4 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.02 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  24.06 
 
 
158 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  24.07 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  24.07 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  28.24 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1434  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.39 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.59 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136753  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
188 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1450  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582503  hitchhiker  0.000352028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  26 
 
 
136 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  25.23 
 
 
136 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 
137 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>