36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1552 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1552  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
132 aa  271  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.15 
 
 
132 aa  248  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523044  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6021  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.14 
 
 
130 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.346989  normal  0.446573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6402  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.77 
 
 
130 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6130  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.94 
 
 
130 aa  156  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5509  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.36 
 
 
130 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.524935 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6244  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.23 
 
 
130 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.46 
 
 
130 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2694  hypothetical protein  58.46 
 
 
132 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2999  glyoxalase family protein  59.38 
 
 
132 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441572  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
130 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5893  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
130 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0389  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.41 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  26.77 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.89 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0432529  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  26.61 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  31.15 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.77 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  28 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2048  methylmalonyl-CoA epimerase  26.27 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_004310  BR1268  lactoylglutathione lyase  28 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  23.53 
 
 
126 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  26.89 
 
 
139 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>