70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2327 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
173 aa  345  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0564  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.06 
 
 
168 aa  288  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2680  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
163 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00951722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1557  hypothetical protein  55.03 
 
 
143 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0324701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12659  cadmium inducible protein cadI  57.45 
 
 
152 aa  158  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123527  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0789  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
166 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1434  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.26 
 
 
161 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2234  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.26 
 
 
141 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.52 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3470  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.94 
 
 
149 aa  151  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4156  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.11 
 
 
151 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4906  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56 
 
 
152 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.8 
 
 
153 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.0139362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2998  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
153 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
153 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4826  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.6 
 
 
159 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.915337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1653  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.97 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00264078  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56 
 
 
145 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26430  lactoylglutathione lyase-like lyase  50.99 
 
 
160 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.258719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02000  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  53.28 
 
 
142 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0535  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.42 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.59 
 
 
154 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3223  glyoxalase family protein  37.6 
 
 
145 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2965  lactoylglutathione lyase, glyoxalase family protein  37.9 
 
 
145 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3188  glyoxalase family protein  37.6 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2900  lactoylglutathione lyase, glyoxalase family protein  36.29 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3209  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0045166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2060  glyoxalase family protein  36.8 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3203  glyoxalase family protein  36.29 
 
 
145 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2973  glyoxalase family protein  35.48 
 
 
145 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000833367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3198  glyoxalase family protein  35.48 
 
 
145 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2265  hypothetical protein  33.12 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715595  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
159 aa  94.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182474  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.17 
 
 
134 aa  91.7  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326037  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.33 
 
 
140 aa  90.9  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.68 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.34 
 
 
161 aa  87.8  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423642  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2346  hypothetical protein  29.94 
 
 
154 aa  87.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.54 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2515  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.14 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90786  normal  0.0126588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1822  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
161 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317046  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5344  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.13 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
162 aa  84  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.498296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5764  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.59 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0960  glyoxalase family protein family  32.54 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0488  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2829  glyoxalase family protein  31.75 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3940  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3578  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0455  glyoxalase family protein family  31.2 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0956574  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0912  hypothetical protein  30.4 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1881  glyoxalase family protein  30.4 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.966577  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0559  hypothetical protein  30.4 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0323612  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1941  glyoxalase family protein  30.4 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2036  glyoxalase family protein  30.4 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.77 
 
 
287 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0614  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 
304 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.97 
 
 
299 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.986343  hitchhiker  0.00000540832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6284  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511658  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2223  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.29 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0432529  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
279 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0509  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 
298 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.95239 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
166 aa  41.2  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>