63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1090 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1090  carbonic anhydrase  100 
 
 
198 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2698  carbonic anhydrase  74.62 
 
 
212 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  36.61 
 
 
165 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  35.14 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  29.11 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  27.22 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  36.36 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  32 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  24.87 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  31.2 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  28.8 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  30.95 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  29.6 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  28.18 
 
 
163 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  28.18 
 
 
163 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  28.18 
 
 
163 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  28.35 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  29.37 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  27.43 
 
 
180 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  25.45 
 
 
162 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  23.64 
 
 
164 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  26.36 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  25.45 
 
 
163 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  26.36 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  25.45 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  28.71 
 
 
134 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  26.36 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  22.09 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  26.36 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  22.54 
 
 
193 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  24.55 
 
 
163 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  24.32 
 
 
205 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  23.12 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  31.15 
 
 
189 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  23.04 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  23.04 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  23.04 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  23.04 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  23.04 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  23.04 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  25.64 
 
 
164 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  25.66 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  23.04 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  20.93 
 
 
186 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  23.04 
 
 
187 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  25.74 
 
 
197 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  26.61 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  22.63 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  31.31 
 
 
109 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  27.68 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  24.86 
 
 
187 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  26.61 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  24.86 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  25.25 
 
 
150 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  25.89 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  26.79 
 
 
150 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  26.79 
 
 
150 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  24.11 
 
 
150 aa  42  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0295  carbonic anhydrase  30.95 
 
 
226 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000632225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  23.64 
 
 
163 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0648  carbonic anhydrase  23.85 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  20.62 
 
 
163 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>