81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0556 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  89.58 
 
 		 96 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  77.89 
 
 		 96 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  70.97 
 
 		 125 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  70.97 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  70.97 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  70.97 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  70.97 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  70.97 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  70.97 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  70.97 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  63.44 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  63.44 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  63.44 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  63.44 
 
 		 96 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  63.44 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  62.37 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  60.22 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  52.22 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  48.28 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  48.91 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  48.86 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  52.44 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  43.96 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  47.13 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  48.35 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  48.35 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  48.89 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  47.25 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  48.35 
 
 		 97 aa  84.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  48.78 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  42.39 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  48.15 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  48.15 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  48.15 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  38.64 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  42.53 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  42.7 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  41.11 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  43.48 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  36.47 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  45.05 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  43.33 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  40 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  36.9 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  32.58 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  36.67 
 
 		 96 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  45.05 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  34.78 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  38.04 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  37.65 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  37.65 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  34.48 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  46.15 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  36.05 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  45.05 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  35.56 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  32.93 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  30.43 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  30.77 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  33.72 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0957  YCII-related  33.33 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  32.05 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0504  hypothetical protein  35.16 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  29.76 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  34.21 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  30.49 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  24.14 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1837  YCII-related  27.78 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1884  YCII-related  27.78 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1818  YCII-related protein  27.78 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  25.97 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>