More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7784 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 452 aa  944    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  69.01 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  61.67 
 
 		 454 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  63.5 
 
 		 456 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  61.42 
 
 		 455 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  61.64 
 
 		 455 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  60.84 
 
 		 454 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  60.58 
 
 		 455 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  60.18 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  56.14 
 
 		 459 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  58.98 
 
 		 455 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  56.76 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  56.14 
 
 		 459 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  56.14 
 
 		 459 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  53.66 
 
 		 450 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  54.2 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  48.44 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  49.56 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  49.22 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  48 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  48.76 
 
 		 447 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  50.33 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  47.24 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  47.78 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  47.01 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  50.22 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  47.33 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  46.71 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  47.78 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  46.65 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  45.41 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  45.41 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  45.41 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  43.97 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  42.6 
 
 		 470 aa  338  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  39.96 
 
 		 459 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  39.78 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  37.41 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  38.08 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  34.33 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  35.54 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  32.51 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  36.94 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  36.94 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  36.94 
 
 		 466 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  32.06 
 
 		 458 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  31.01 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  31.01 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  36.92 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  36.1 
 
 		 444 aa  209  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  35.12 
 
 		 466 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  32.1 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  38.27 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  35.92 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  35.98 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  35.16 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  35.9 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  35.22 
 
 		 444 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.58 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  36.12 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  32.03 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 		 450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  35.48 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  31.91 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.31 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.31 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  35.84 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  35.48 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.31 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  35.22 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  31.69 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  32.58 
 
 		 467 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.84 
 
 		 439 aa  197  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  35.19 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  35.19 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  35.19 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  35.19 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  34.95 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  34.95 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  34.41 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  31.69 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  33.16 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  33.51 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.87 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.87 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  33.6 
 
 		 444 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  33.33 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  33.58 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  32.97 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  33.07 
 
 		 476 aa  193  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  31.69 
 
 		 449 aa  192  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  32.88 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.06 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  34.41 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  33.33 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>