More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2397 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  100 
 
 
572 aa  1117    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  71.4 
 
 
576 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  62.5 
 
 
599 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  65.53 
 
 
565 aa  715    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  57.49 
 
 
556 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  59.32 
 
 
551 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  56.51 
 
 
556 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  57.68 
 
 
556 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  56.32 
 
 
556 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  40.85 
 
 
557 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  36.49 
 
 
571 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  33.46 
 
 
569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  33.46 
 
 
569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.35 
 
 
560 aa  273  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.33 
 
 
591 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  35.62 
 
 
572 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  30.7 
 
 
565 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0765  sulphate transporter  35.91 
 
 
573 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.284221  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  34.87 
 
 
556 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  29.59 
 
 
574 aa  250  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.15 
 
 
588 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.1 
 
 
584 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  30.81 
 
 
578 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  33.77 
 
 
576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.8 
 
 
585 aa  240  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  30.22 
 
 
573 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  34.15 
 
 
570 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.15 
 
 
570 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.15 
 
 
570 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.15 
 
 
570 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  34.15 
 
 
570 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  34.15 
 
 
570 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  33.03 
 
 
590 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  31.47 
 
 
575 aa  232  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  33.96 
 
 
570 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  29.98 
 
 
568 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  29.32 
 
 
571 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  34.05 
 
 
583 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  29.98 
 
 
568 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  30.11 
 
 
583 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  29.98 
 
 
568 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  30.02 
 
 
575 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.8 
 
 
586 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  30.14 
 
 
576 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  31.89 
 
 
582 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  34.59 
 
 
570 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  30.96 
 
 
573 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  31.99 
 
 
587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  35.79 
 
 
573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  31.22 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  31.82 
 
 
590 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  30.24 
 
 
570 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  33.77 
 
 
570 aa  220  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  32.06 
 
 
596 aa  220  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  31.07 
 
 
578 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  30.24 
 
 
570 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  29.07 
 
 
575 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  28.83 
 
 
608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.39 
 
 
588 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  34.22 
 
 
569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  30.83 
 
 
579 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  28.87 
 
 
580 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  30.46 
 
 
559 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.63 
 
 
585 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  28.75 
 
 
626 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  31.66 
 
 
574 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  33.33 
 
 
592 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  31.01 
 
 
595 aa  210  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  32.22 
 
 
570 aa  209  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  29.16 
 
 
588 aa  209  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  33.46 
 
 
590 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  31.95 
 
 
566 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  29.26 
 
 
567 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  28.14 
 
 
585 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  30.99 
 
 
569 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.76 
 
 
574 aa  204  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  28.31 
 
 
600 aa  203  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  30.94 
 
 
730 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  29.25 
 
 
579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  30 
 
 
570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  29.25 
 
 
579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.23 
 
 
605 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  30.47 
 
 
624 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  28.73 
 
 
586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  26.5 
 
 
573 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  27.79 
 
 
585 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  27.79 
 
 
585 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  27.79 
 
 
585 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  27.79 
 
 
585 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  29.03 
 
 
570 aa  200  7e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  31.47 
 
 
572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.46333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  31.47 
 
 
619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  28.9 
 
 
585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  31.47 
 
 
572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  29.55 
 
 
570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.98 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  31.23 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  31.15 
 
 
588 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  28.93 
 
 
578 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  28.14 
 
 
585 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>