More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1584 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  100 
 
 
556 aa  1071    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  78.06 
 
 
556 aa  773    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  82.89 
 
 
551 aa  778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  77.7 
 
 
556 aa  794    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  85.22 
 
 
556 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  56.12 
 
 
565 aa  565  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  56.55 
 
 
572 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  55.81 
 
 
576 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  56.3 
 
 
599 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  41.31 
 
 
557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.69 
 
 
588 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  37.28 
 
 
574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  36.38 
 
 
571 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  34.63 
 
 
584 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.42 
 
 
569 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.42 
 
 
569 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  36.04 
 
 
583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  38.19 
 
 
556 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.53 
 
 
560 aa  243  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  33.33 
 
 
575 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0765  sulphate transporter  38.9 
 
 
573 aa  238  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.284221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  33.33 
 
 
578 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  32.47 
 
 
573 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  31.68 
 
 
565 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  35.42 
 
 
591 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.64 
 
 
572 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.03 
 
 
590 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  29.84 
 
 
571 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  38.03 
 
 
570 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.57 
 
 
585 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  34.46 
 
 
570 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  34.26 
 
 
559 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  31.73 
 
 
590 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  32.9 
 
 
568 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  33.4 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.4 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  33.4 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.4 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.4 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  33.4 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  32.39 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  34.93 
 
 
570 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  31.19 
 
 
575 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  33.21 
 
 
570 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  32.97 
 
 
582 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  30.7 
 
 
567 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  31.58 
 
 
578 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  32.56 
 
 
576 aa  212  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  33.13 
 
 
573 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  31.84 
 
 
568 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.8 
 
 
586 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  31.84 
 
 
568 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  32.55 
 
 
588 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  32.94 
 
 
576 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  33.07 
 
 
570 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  32.08 
 
 
583 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  33.04 
 
 
585 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.59 
 
 
558 aa  207  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  33.98 
 
 
565 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  31.05 
 
 
595 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  30.56 
 
 
596 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  30.81 
 
 
580 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  32.63 
 
 
624 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  30.13 
 
 
566 aa  204  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  34.01 
 
 
569 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  33.87 
 
 
605 aa  203  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  31.08 
 
 
597 aa  203  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.12 
 
 
579 aa  200  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  33.2 
 
 
619 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  33.2 
 
 
572 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.46333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  33.2 
 
 
572 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1268  sulphate transporter  34.23 
 
 
658 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0855544  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  33.06 
 
 
592 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  35.43 
 
 
587 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  30.02 
 
 
588 aa  196  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  29.38 
 
 
570 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04796  putative sulfate transporter transmembrane protein  33.52 
 
 
567 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  35.14 
 
 
569 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  32.11 
 
 
566 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  33.46 
 
 
583 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.86 
 
 
574 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  28.28 
 
 
586 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  30.8 
 
 
576 aa  194  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  33.96 
 
 
574 aa  193  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  30.85 
 
 
570 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  32.65 
 
 
590 aa  193  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  32.58 
 
 
577 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  31.99 
 
 
550 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  30.52 
 
 
600 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  29.52 
 
 
626 aa  190  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  30.15 
 
 
591 aa  189  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  29.51 
 
 
579 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  29.51 
 
 
579 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  30.37 
 
 
570 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  32.56 
 
 
592 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  30.18 
 
 
574 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  30.54 
 
 
570 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  30.58 
 
 
585 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  29.32 
 
 
703 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  30.82 
 
 
620 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>