More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1387 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 472 aa  922    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287685  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1629  PP family ATPase  75.52 
 
 		 476 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379742  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  73.91 
 
 		 481 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14647  hitchhiker  0.00723394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  64.9 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1980  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  64.9 
 
 		 468 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  64.77 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6002  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  64.98 
 
 		 473 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2075  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  64.98 
 
 		 473 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5381  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  64.69 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0261986  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1206  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  65.25 
 
 		 468 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2542  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.85 
 
 		 489 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2156  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.85 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1653  cell cycle protein mesJ  60.85 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000820354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2678  cell cycle protein mesJ  60.53 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0688879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2593  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.53 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1944  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.69 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3159  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.85 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1429  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.85 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  41.96 
 
 		 425 aa  249  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1011  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.44 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.258759  normal  0.14023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1809  hypothetical protein  36.94 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1105  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.63 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340413  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1170  putative cell cycle protein  43.13 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1178  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.57 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.509041  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1088  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  39.51 
 
 		 487 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00200666  normal  0.0296865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1125  PP-loop  39.64 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00891393  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.41 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.53 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  34.33 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.25 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1673  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.95 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.76 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0258  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.24 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.921604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0274  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.67 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.433905  normal  0.237659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0263  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.76 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.144292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1237  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 429 aa  193  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0934  cell-cycle protein  30.57 
 
 		 427 aa  192  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.504247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0277  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.09 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  40.18 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0258  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.53 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.25 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.7 
 
 		 462 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3415  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.41 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  33.26 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0192  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.13 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.99 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.62 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0849  tRNA(Ile)-lysidine synthase  34.93 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0181  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.13 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.49 
 
 		 436 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  36.01 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2453  putative cell cycle protein  40.32 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.19 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1084  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.62 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  33.02 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0190  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.67 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0199  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.67 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00186  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.65 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00185  hypothetical protein  35.65 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.434611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3472  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.67 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878016  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0726  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.238503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.76 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  31.63 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03220  hypothetical protein  32.88 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1155  cell cycle protein MesJ  32.65 
 
 		 497 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.97 
 
 		 427 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  36.75 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2619  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.15 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1118  hypothetical protein  39.29 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.21 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01389  cell cycle protein MesJ  31.79 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.683525  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.75 
 
 		 335 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.379803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.37 
 
 		 427 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.31 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1627  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.75 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3036  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.83 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.44 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.63 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1289  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.38 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0103  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.35 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1501  hypothetical protein  40.37 
 
 		 439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  42.91 
 
 		 326 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.42 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0580  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  37.84 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0306545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2962  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.97 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3147  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.62 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2510  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.16 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2323  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.65 
 
 		 347 aa  161  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368291  hitchhiker  0.0000894002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38820  PP-loop-tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.41 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1286  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.41 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.170507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3342  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.05 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.73 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.867953  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1352  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.72 
 
 		 320 aa  156  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3765  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.26 
 
 		 436 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000300868  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2799  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.68 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.772923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.45 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3145  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31 
 
 		 494 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0165615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4939  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.39 
 
 		 308 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.457595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3401  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.51 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1551  cell cycle protein mesJ, putative  35.73 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>