35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1320 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  297  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  58.7 
 
 
144 aa  160  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  60.99 
 
 
144 aa  155  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  60.99 
 
 
144 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  60.99 
 
 
144 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  60.99 
 
 
144 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  60.99 
 
 
144 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  60.99 
 
 
144 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  60.99 
 
 
144 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  60.99 
 
 
144 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  65.07 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  68.67 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  60.8 
 
 
144 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  60.8 
 
 
144 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  60.8 
 
 
144 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  60.8 
 
 
144 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  61.6 
 
 
144 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  60.8 
 
 
144 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  51.05 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  49.64 
 
 
141 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  47.79 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  43.38 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  43.7 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  49.64 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  43.92 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  46.72 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  41.18 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  41.48 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  42.65 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  41.3 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  41.3 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  41.01 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  41.84 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  43.7 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  28.26 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>