More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0017 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0017  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 132 bp  71.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 132 bp  71.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r27  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 122 bp  69.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  87.32 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  67.9  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0027  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000434608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  97.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0060  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000527991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0086  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0069  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0057  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0015  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0168638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0081  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000871424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0038  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000916251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0021  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0010  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00985283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0057  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0039  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3003  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3006  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3009  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3012  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3015  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3019  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r06  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r12  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r15  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r18  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r21  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r24  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r28  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 127 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 122 bp  58  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0023  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0081  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 123 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0030  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0066  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.523517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0060  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0074  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 123 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.376676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032a  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 128 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0032  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 123 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.581266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0009  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 123 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0261857  hitchhiker  0.000595412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0025  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 123 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0016  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0028  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.678943  hitchhiker  0.00874775 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0004  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.357792  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 118 bp  54  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 114 bp  54  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>