More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1954 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1954  ribosomal protein L11  100 
 
 
140 aa  277  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0370105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  55 
 
 
141 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  55 
 
 
141 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  55.71 
 
 
141 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  55.4 
 
 
141 aa  161  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  54.68 
 
 
141 aa  160  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  54.35 
 
 
145 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  54.29 
 
 
140 aa  157  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  53.24 
 
 
140 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
141 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  55 
 
 
140 aa  157  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  55 
 
 
140 aa  157  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  52.86 
 
 
141 aa  156  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  52.14 
 
 
141 aa  156  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 
141 aa  155  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
141 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 
142 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  52.52 
 
 
141 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
141 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  51.08 
 
 
142 aa  153  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
141 aa  152  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  50.72 
 
 
142 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  50.36 
 
 
143 aa  152  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 
141 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 
141 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  52.17 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  50.72 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  52.17 
 
 
143 aa  151  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 
141 aa  150  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  52.86 
 
 
141 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 
142 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  52.9 
 
 
143 aa  149  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 
140 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  52.17 
 
 
142 aa  149  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  50.36 
 
 
143 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 
141 aa  149  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  51.43 
 
 
140 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  49.65 
 
 
142 aa  148  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 
141 aa  148  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  51.45 
 
 
143 aa  148  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  51.43 
 
 
140 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  50.72 
 
 
143 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  49.64 
 
 
143 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 
141 aa  147  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  51.45 
 
 
142 aa  147  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  50 
 
 
143 aa  147  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  50 
 
 
141 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
141 aa  147  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  50 
 
 
140 aa  147  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
142 aa  146  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
142 aa  146  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  50.36 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  50.71 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 
143 aa  144  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  52.17 
 
 
163 aa  144  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  49.29 
 
 
140 aa  144  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  50 
 
 
142 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  48.57 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  49.28 
 
 
142 aa  144  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 
143 aa  144  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  47.48 
 
 
141 aa  144  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  49.64 
 
 
142 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  50 
 
 
143 aa  144  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  49.29 
 
 
141 aa  143  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 
141 aa  143  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 
141 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  48.18 
 
 
143 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  48.2 
 
 
140 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  48.18 
 
 
143 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  47.14 
 
 
141 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  47.86 
 
 
141 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 
143 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
143 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  47.86 
 
 
140 aa  141  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  48.2 
 
 
140 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  50.71 
 
 
146 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  49.64 
 
 
140 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>