27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1074 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1074  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1075  hypothetical protein  51.33 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1449  hypothetical protein  30.86 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1448  hypothetical protein  33.13 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000174999  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0393  hypothetical protein  33.56 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0887  hypothetical protein  32.96 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182556  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1264  hypothetical protein  36.05 
 
 
226 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.720541  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1091  biopolymer transport ExbB protein  34.46 
 
 
227 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  28.24 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
165 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0296  NLP/P60 protein  26.67 
 
 
561 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0918  hypothetical protein  29.9 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4116  hypothetical protein  25.69 
 
 
265 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  28.05 
 
 
333 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
302 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  31.75 
 
 
298 aa  45.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  26.83 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  33.7 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4142  hypothetical protein  25.69 
 
 
270 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  29.6 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  25.81 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  28 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  28.73 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  34.12 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  32.38 
 
 
231 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  30.11 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
454 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>