24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4142 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4142  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4000  hypothetical protein  92.55 
 
 
262 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4116  hypothetical protein  89.81 
 
 
265 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0426  hypothetical protein  51.55 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28873  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0779  hypothetical protein  44.64 
 
 
228 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0772  hypothetical protein  43.9 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0772  hypothetical protein  43.45 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0735  hypothetical protein  42.44 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0198951  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1448  hypothetical protein  26.83 
 
 
205 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000174999  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  30.82 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  30.91 
 
 
181 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0393  hypothetical protein  23.2 
 
 
229 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  33.33 
 
 
333 aa  45.8  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1264  hypothetical protein  25.77 
 
 
226 aa  45.8  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.720541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0740  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.53 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5119  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.553866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0918  hypothetical protein  25.33 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  27.66 
 
 
165 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  40 
 
 
374 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1074  hypothetical protein  25.69 
 
 
199 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  38.89 
 
 
188 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
188 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>