39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4000 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4000  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  490  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4142  hypothetical protein  95.2 
 
 
270 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4116  hypothetical protein  86.57 
 
 
265 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0426  hypothetical protein  54.18 
 
 
266 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28873  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0779  hypothetical protein  44.17 
 
 
228 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0772  hypothetical protein  44.03 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0772  hypothetical protein  44.03 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0735  hypothetical protein  44.03 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0198951  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1448  hypothetical protein  26.22 
 
 
205 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000174999  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  32.23 
 
 
202 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  30.56 
 
 
181 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0393  hypothetical protein  24.39 
 
 
229 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0740  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 
189 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  27.5 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  33.33 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
578 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1264  hypothetical protein  27.33 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.720541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0918  hypothetical protein  26 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  39.29 
 
 
582 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1074  hypothetical protein  25.87 
 
 
199 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5119  NLP/P60 protein  31.3 
 
 
387 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.553866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  28.89 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  38.89 
 
 
579 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.89 
 
 
580 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  38.89 
 
 
582 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  38.89 
 
 
598 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
575 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  35.85 
 
 
582 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
418 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  30.43 
 
 
436 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  38.89 
 
 
341 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  30.43 
 
 
436 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  30.43 
 
 
436 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  35.85 
 
 
577 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
374 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  21.58 
 
 
165 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  34.38 
 
 
188 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
188 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  36.71 
 
 
333 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>