19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0421 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  100 
 
 
719 aa  1392    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  31.36 
 
 
922 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  29.62 
 
 
922 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.11 
 
 
858 aa  60.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  34.41 
 
 
1160 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  21.31 
 
 
978 aa  54.7  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  21.31 
 
 
978 aa  54.7  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  22.27 
 
 
1185 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  25 
 
 
979 aa  52  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  22.57 
 
 
1155 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  27.44 
 
 
664 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  30.28 
 
 
1149 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.14 
 
 
724 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  20.89 
 
 
1153 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  29.84 
 
 
812 aa  47  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.34 
 
 
1171 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  32.61 
 
 
830 aa  45.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  24.62 
 
 
1163 aa  45.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  29.41 
 
 
821 aa  44.3  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>