50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1632 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  48.11 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  40.93 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  39.58 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  38.5 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  40.96 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  37.31 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  42.24 
 
 		 243 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  41.61 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  40.36 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  37.04 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  37.04 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  41.21 
 
 		 237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  39.88 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  38.07 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  37.35 
 
 		 215 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  38.79 
 
 		 250 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  38.46 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  33.51 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  34.05 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  30.81 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  31.75 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  31.16 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  30.21 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  28.93 
 
 		 432 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  31.17 
 
 		 478 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  30.52 
 
 		 475 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  32.17 
 
 		 479 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  32.17 
 
 		 479 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 473 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 473 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 473 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 473 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 473 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 473 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  26.5 
 
 		 459 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  33.06 
 
 		 478 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  33.06 
 
 		 478 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  33.06 
 
 		 478 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  31.9 
 
 		 479 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  31.9 
 
 		 479 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  31.9 
 
 		 479 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  34.72 
 
 		 459 aa  41.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  28.24 
 
 		 442 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>