236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1033 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  100 
 
 		 400 aa  806    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  68.24 
 
 		 410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  52.91 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  50.41 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  41.64 
 
 		 402 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  43.85 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  37.8 
 
 		 422 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  36.48 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  38.23 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  38.46 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  37.57 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  37.18 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  38.81 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  37.78 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  38.07 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  37.36 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  38.68 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  38.23 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  36.19 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  38.16 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 410 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  35.25 
 
 		 410 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  33.42 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.13 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  34.13 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 379 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.13 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.13 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.86 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  34.69 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.32 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.32 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  33.16 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  33.45 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  26.39 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  27.54 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  30.06 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  27.37 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  28.9 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  27.03 
 
 		 392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  29.97 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  29.97 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  28.66 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.91 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  25.47 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  25.47 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.47 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.47 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.47 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.2 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  24.67 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.09 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  25.08 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.09 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  26.73 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.09 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.09 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  26.22 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  25.9 
 
 		 391 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  24.04 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.56 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  25.34 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.03 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  25.81 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  24.03 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>