18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10930 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  836    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  46.46 
 
 		 447 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  44.7 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  41.47 
 
 		 415 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  41.41 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  47.88 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  41.27 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  45.51 
 
 		 405 aa  280  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  40 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  26.18 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.94 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  23.08 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  20.44 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  24.39 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  28.41 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  27.27 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3584  hypothetical protein  28.1 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.121359  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  28.79 
 
 		 568 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>