52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7506 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  91.95 
 
 
176 aa  330  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  91.95 
 
 
176 aa  330  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  91.95 
 
 
176 aa  330  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  60.23 
 
 
200 aa  200  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  38.07 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  36.78 
 
 
175 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  39.02 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  35.38 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.31 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  31.93 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  27.54 
 
 
147 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.88 
 
 
151 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  28.15 
 
 
148 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.77 
 
 
145 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  28.07 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  30.63 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  25.85 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  25 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  26.88 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  29.31 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  26.51 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  32.94 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  31.03 
 
 
190 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.41 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  27.37 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  32 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  30.77 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  30.51 
 
 
172 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  30.49 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  33.9 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  33.9 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  33.9 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  33.9 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  33.9 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  27.34 
 
 
138 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  26.45 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  29.13 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  29.41 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  26.67 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  27.69 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  26.99 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  30.68 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  26.24 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  28.44 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3583  OsmC family protein  28.72 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  28.05 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  25.7 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  26.61 
 
 
206 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  27.59 
 
 
180 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  28.21 
 
 
133 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  22.78 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>