35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6811 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6811    100 
 
 		 2852 bp  5654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    80.87 
 
 		 1540 bp  418  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  79.62 
 
 		 1389 bp  329  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  79.37 
 
 		 1542 bp  307  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  82.82 
 
 		 576 bp  303  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  81.77 
 
 		 1539 bp  297  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  80.87 
 
 		 1548 bp  258  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    81.02 
 
 		 1556 bp  252  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  78.49 
 
 		 1647 bp  222  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  79.14 
 
 		 1539 bp  176  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4553    83.82 
 
 		 666 bp  143  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0531588 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7403    83.71 
 
 		 198 bp  123  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4555    86.92 
 
 		 237 bp  123  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0946294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  81.05 
 
 		 1602 bp  119  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4554    83.85 
 
 		 480 bp  113  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0536907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1539    91.67 
 
 		 1126 bp  95.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  82.76 
 
 		 1539 bp  89.7  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  82.76 
 
 		 1539 bp  89.7  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  90.41 
 
 		 1539 bp  89.7  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  90.41 
 
 		 1539 bp  89.7  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  90.41 
 
 		 1539 bp  89.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  80.98 
 
 		 867 bp  87.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  84.21 
 
 		 1539 bp  83.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1916  hypothetical protein  95.92 
 
 		 138 bp  81.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0200815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3812  hypothetical protein  95.92 
 
 		 138 bp  81.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5960    87.67 
 
 		 389 bp  73.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6921    83.65 
 
 		 327 bp  71.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 1539 bp  65.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  90.57 
 
 		 1158 bp  65.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7463    84.09 
 
 		 1539 bp  63.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1167    79.41 
 
 		 225 bp  60  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0429    96.88 
 
 		 267 bp  56  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048687  hitchhiker  0.0000000127631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0303    84 
 
 		 369 bp  54  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.260436 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0140    83.33 
 
 		 423 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2167  hypothetical protein  85.96 
 
 		 324 bp  50.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.232166  hitchhiker  0.0000070701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>