30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4363 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  98.92 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  98.56 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  83.39 
 
 		 277 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  66.79 
 
 		 277 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.31 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.23 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.44 
 
 		 276 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.44 
 
 		 276 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  32.56 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.21 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.26 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.47 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.61 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.93 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  26.91 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  25.51 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.07 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.2 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  22.38 
 
 		 409 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.55 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  25.37 
 
 		 268 aa  42  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>