30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1631 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  100 
 
 		 606 aa  1229    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  44.75 
 
 		 502 aa  259  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  43.11 
 
 		 328 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  41.59 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  39.24 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  36.18 
 
 		 701 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  36.18 
 
 		 701 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  36.18 
 
 		 701 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  41.12 
 
 		 300 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  41.12 
 
 		 300 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  40.18 
 
 		 357 aa  212  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  38.46 
 
 		 503 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  35.07 
 
 		 676 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  35.07 
 
 		 680 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  35.07 
 
 		 676 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  41.5 
 
 		 386 aa  190  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  35.87 
 
 		 676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  35.73 
 
 		 692 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  31.83 
 
 		 371 aa  113  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  30.5 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  27.22 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0806  hypothetical protein  26.12 
 
 		 410 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  28.4 
 
 		 320 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5502  hypothetical protein  24.16 
 
 		 350 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1306  hypothetical protein  25.36 
 
 		 370 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.12 
 
 		 648 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  28.48 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1433  hypothetical protein  28.75 
 
 		 350 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.49 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>