More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5528 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  98.72 
 
 
438 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  82.86 
 
 
437 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  82.86 
 
 
437 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  93.86 
 
 
438 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  82.86 
 
 
437 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  94.88 
 
 
438 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  100 
 
 
391 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  94.88 
 
 
438 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  94.88 
 
 
438 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  82.86 
 
 
437 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  82.86 
 
 
437 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  91.56 
 
 
438 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  83.38 
 
 
452 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  59.95 
 
 
442 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  60.21 
 
 
442 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  58.67 
 
 
454 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  58.73 
 
 
442 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  59.95 
 
 
418 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  58.61 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  58.66 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  57.36 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  57.62 
 
 
410 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  59.69 
 
 
441 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  50 
 
 
435 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  49.61 
 
 
463 aa  362  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  50.14 
 
 
453 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  49.62 
 
 
451 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.61 
 
 
444 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.11 
 
 
444 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  46.56 
 
 
426 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  47.03 
 
 
622 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  46.88 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.21 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.87 
 
 
463 aa  339  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  48.01 
 
 
463 aa  339  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  48.63 
 
 
447 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  48.84 
 
 
450 aa  335  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  47.03 
 
 
462 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  48.91 
 
 
448 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  47.66 
 
 
460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  44.96 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  49.23 
 
 
444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.6 
 
 
443 aa  325  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  46.25 
 
 
446 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.94 
 
 
444 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  48.74 
 
 
464 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  45.99 
 
 
446 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.41 
 
 
627 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  48.34 
 
 
441 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.26 
 
 
448 aa  318  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  45.22 
 
 
456 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  47.69 
 
 
460 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  45.9 
 
 
450 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  45.22 
 
 
473 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  44.7 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.99 
 
 
448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.03 
 
 
625 aa  305  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  48.22 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  48.73 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  49.58 
 
 
448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.26 
 
 
448 aa  298  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.58 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  40.1 
 
 
450 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  40.1 
 
 
450 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  42.24 
 
 
444 aa  292  8e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  47.97 
 
 
438 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  49.31 
 
 
435 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  49.31 
 
 
435 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  49.03 
 
 
435 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  49.03 
 
 
435 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  49.03 
 
 
435 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  41.12 
 
 
453 aa  286  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  47.35 
 
 
448 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  41.83 
 
 
464 aa  282  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  41.29 
 
 
444 aa  278  9e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  41.24 
 
 
425 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  41.35 
 
 
446 aa  272  6e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  40.93 
 
 
434 aa  272  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  41.04 
 
 
525 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  49.31 
 
 
520 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.97 
 
 
439 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  39.02 
 
 
412 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  38.99 
 
 
489 aa  266  5e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.112546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  39.74 
 
 
412 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  39.74 
 
 
412 aa  266  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  39.74 
 
 
412 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  39.74 
 
 
412 aa  266  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  39.74 
 
 
412 aa  266  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  39.74 
 
 
412 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  39.74 
 
 
412 aa  266  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  39.74 
 
 
412 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  39.74 
 
 
412 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  42.25 
 
 
449 aa  264  2e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  38.78 
 
 
412 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.67 
 
 
430 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  40 
 
 
410 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  38.39 
 
 
473 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  39.59 
 
 
409 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  39.59 
 
 
409 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  38.76 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>