More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4484 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  94.51 
 
 		 511 aa  972    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  73.37 
 
 		 513 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  79.09 
 
 		 517 aa  833    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  73.05 
 
 		 512 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  79.09 
 
 		 522 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  96.48 
 
 		 511 aa  1014    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  79.29 
 
 		 517 aa  834    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  94.57 
 
 		 516 aa  1000    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  72.43 
 
 		 515 aa  789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  94.19 
 
 		 516 aa  996    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  100 
 
 		 511 aa  1050    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  94.19 
 
 		 516 aa  996    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  79.09 
 
 		 522 aa  832    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  79.09 
 
 		 522 aa  832    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  79.09 
 
 		 522 aa  832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  78.7 
 
 		 517 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  79.09 
 
 		 522 aa  832    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  64.02 
 
 		 518 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  98.06 
 
 		 516 aa  1033    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  59.77 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  58.65 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  59.05 
 
 		 505 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  58.85 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  59.09 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  59.45 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  57.91 
 
 		 502 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  57.26 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  56.37 
 
 		 501 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  55.86 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  56.86 
 
 		 509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  52.67 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  51.49 
 
 		 502 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  51.19 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  50.99 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  50.69 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  50.89 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  51.59 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  50.39 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  50.8 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  48.74 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  50.2 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  55.53 
 
 		 594 aa  466  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  48.21 
 
 		 520 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  46.71 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  35.39 
 
 		 489 aa  233  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.41 
 
 		 482 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  31.83 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  28.93 
 
 		 586 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  35.37 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.35 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  32.55 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  30.42 
 
 		 487 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  28.32 
 
 		 499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  32.26 
 
 		 496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  32.67 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  30.68 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  30.89 
 
 		 572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.83 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  32.28 
 
 		 497 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  30.56 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  30.48 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  29.15 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  28.96 
 
 		 474 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  30.16 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.65 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.26 
 
 		 501 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  29.33 
 
 		 493 aa  150  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  30.21 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  30.47 
 
 		 565 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  28.63 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  28.87 
 
 		 535 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  29.75 
 
 		 511 aa  147  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  32.55 
 
 		 489 aa  147  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  28.6 
 
 		 554 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  26.6 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.42 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.34 
 
 		 497 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  25.59 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  26.05 
 
 		 491 aa  143  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.34 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.74 
 
 		 497 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.34 
 
 		 497 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  30.34 
 
 		 497 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.47 
 
 		 536 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.16 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.46 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  29.19 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  32.6 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  31.24 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  26.77 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  27.93 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  29.19 
 
 		 497 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  26.59 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  29.59 
 
 		 518 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  28.73 
 
 		 497 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  28.73 
 
 		 497 aa  136  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  28.73 
 
 		 497 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  27.89 
 
 		 452 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  30 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  28.73 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>